Согласно требованиям НК РФ налоговый агент обязан удержать начисленную сумму НДФЛ непосредственно из доходов налогоплательщика при их фактической выплате. Каких-либо особенностей выполнения функций налогового агента при выплате налогоплательщикам сумм дохода на основании решения суда Налоговый кодекс не устанавливает.
Учреждение обязано выплатить физическому лицу именно ту сумму, которая указана в решении суда – этого требует Гражданский кодекс. Поэтому в случае, если при вынесении решения суд не производит разделения сумм, причитающихся физическому лицу и подлежащих удержанию с физического лица, учреждение – налоговый агент не имеет возможности удержать у налогоплательщика НДФЛ. В таком случае начисление НДФЛ по кредиту счета 303 01 "Расчеты по налогу на доходы физических лиц" не производится, а по счету 302 ХХ начисления отражаются в полной сумме причитающихся выплат согласно решению суда.
Минфин России также напоминает, что в этой ситуации налоговый агент обязан в срок не позднее 1 марта года, следующего за истекшим налоговым периодом, в котором возникла такая ситуация, письменно сообщить налогоплательщику – физлицу и налоговому органу по месту своего учета: